Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ArxO35085 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ArxO35085 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ArxO35085 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ArxO35085 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ArxO35085 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ArxO35085 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ArxO35085 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ArxO35085 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArxO35085 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArxO35085 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArxO35085 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ArxO35085 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ArxO35085 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ArxO35085 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ArxO35085 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ArxO35085 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ArxO35085 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ArxO35085 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ArxO35085 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ArxO35085 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ArxO35085 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ArxO35085 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ArxO35085 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ArxO35085 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ArxO35085 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ArxO35085 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ArxO35085 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ArxO35085 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArxO35085 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArxO35085 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArxO35085 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ArxO35085 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ArxO35085 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ArxO35085 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ArxO35085 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ArxO35085 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ArxO35085 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ArxO35085 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArxO35085 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ArxO35085 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArxO35085 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ArxO35085 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArxO35085 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArxO35085 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArxO35085 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArxO35085 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ArxO35085 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ArxO35085 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ArxO35085 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ArxO35085 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ArxO35085 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ArxO35085 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ArxO35085 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ArxO35085 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArxO35085 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArxO35085 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArxO35085 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArxO35085 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ArxO35085 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ArxO35085 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ArxO35085 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ArxO35085 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms