Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-Q1O19441 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Q1O19441 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q1O19441 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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