Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casq1O09165 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casq1O09165 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casq1O09165 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casq1O09165 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casq1O09165 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casq1O09165 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Casq1O09165 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casq1O09165 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casq1O09165 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casq1O09165 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casq1O09165 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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