Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac1O09106 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac1O09106 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac1O09106 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac1O09106 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac1O09106 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac1O09106 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac1O09106 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac1O09106 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hdac1O09106 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac1O09106 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hdac1O09106 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac1O09106 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac1O09106 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms