Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20939L7N243 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20939L7N243 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20939L7N243 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms