Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h12bG3X9I7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h12bG3X9I7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h12bG3X9I7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zc3h12bG3X9I7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms