Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r76F8VQ63 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r76F8VQ63 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r76F8VQ63 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r76F8VQ63 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms