Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LctF8VPT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LctF8VPT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LctF8VPT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LctF8VPT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LctF8VPT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LctF8VPT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms