Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20538F6Z9R1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20538F6Z9R1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20538F6Z9R1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms