Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc6F2Z461 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc6F2Z461 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc6F2Z461 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc6F2Z461 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Herc6F2Z461 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc6F2Z461 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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