Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa35E9QLQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa35E9QLQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms