Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfta2E9PXB6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sfta2E9PXB6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfta2E9PXB6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms