Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Abca16E9PWJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abca16E9PWJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abca16E9PWJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abca16E9PWJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Abca16E9PWJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Abca16E9PWJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms