Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifit3bE9PV48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit3bE9PV48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms