Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17660B9UIU9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17660B9UIU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17660B9UIU9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17660B9UIU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms