Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R2

Spin2d, Spindlin family, member 2D, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2dB1B0R2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spin2dB1B0R2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spin2dB1B0R2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2dB1B0R2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spin2dB1B0R2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms