Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trabd2bB1ATG9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trabd2bB1ATG9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trabd2bB1ATG9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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