Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r232A2RTT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r232A2RTT5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms