Protein–RNA interactions for Protein: A2AJX4

Malrd1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malrd1A2AJX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Malrd1A2AJX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Malrd1A2AJX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Malrd1A2AJX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Malrd1A2AJX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Malrd1A2AJX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms