Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbbp8nlA2ABX0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms