Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA9

Scgb2b18, ABPBG18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b18A0A087WPA9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scgb2b18A0A087WPA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scgb2b18A0A087WPA9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scgb2b18A0A087WPA9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scgb2b18A0A087WPA9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scgb2b18A0A087WPA9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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Scgb2b18A0A087WPA9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scgb2b18A0A087WPA9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scgb2b18A0A087WPA9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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