Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B652

Trav5-4, T cell receptor alpha variable 5-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5-4A0A075B652 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18,96■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Trav5-4A0A075B652 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Trav5-4A0A075B652 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Trav5-4A0A075B652 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18,83■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Trav5-4A0A075B652 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,81■□□□□ 0,6
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