RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626343.2

PCBP1-AS1-289, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 910 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.71■□□□□ 0.27
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.03□□□□□ -0.16
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.72□□□□□ -0.21
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 KCNA4P22459 653 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ADRA2BP18089 450 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.03□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SLC24A1O60721 1099 aa12.91□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.73□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.5□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FOXD1Q16676 465 aa12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZBTB22O15209 634 aa12.27□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.92□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FKBP8Q14318 412 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MSH5O43196 834 aa11.46□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLCB2Q00722 1185 aa11.43□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 BCANQ96GW7 911 aa11.37□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SLC4A2P04920 1241 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 POTEDQ86YR6 584 aa11.06□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FBXO3Q9UK99 471 aa11.06□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 FBLN2P98095 1184 aa10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PKD2Q13563 968 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CFAP44Q96MT7 982 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ARXQ96QS3 562 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.67□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PROM2Q8N271 834 aa10.66□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NBR1Q14596 966 aa10.63□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HOMEZQ8IX15 550 aa10.54□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 KLHL34Q8N239 644 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SPOCK2Q92563 424 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RGL2O15211 777 aa10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 APLP2Q06481 763 aa10.43□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 C14orf37Q86TY3 774 aa10.42□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.41□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 POLA2Q14181 598 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 MIER1Q8N108 512 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 TRIM41Q8WV44 630 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 PLEKHG5O94827 1062 aa10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-289ENST00000626343 P3H3Q8IVL6 736 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms