RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614998.4

PER3-209, Transcript of period circadian regulator 3, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PER3, Length 6,261 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PER3-209	ENST00000614998	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	OR2T3	Q8NH03	318 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MID1	O15344	667 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	FUT4	P22083	530 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	NMBR	P28336	390 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	IL10RB	Q08334	325 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ZNF460	Q14592	562 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	AGAP2	Q99490	1192 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	HTR7	P34969	479 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CLCNKA	P51800	687 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	BNIP1	Q12981	228 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PDCD5	O14737	125 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PGR	P06401	933 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	COL6A2	P12110	1019 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	TPSB2	P20231	275 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	LILRA4	P59901	499 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PRKCD	Q05655	676 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	TPSAB1	Q15661	275 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	IFI44L	Q53G44	452 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	HSPA12A	O43301	675 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MTX2	O75431	263 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	HOXB2	P14652	356 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PTGER3	P43115	390 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ZNF234	Q14588	700 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	REP15	Q6BDI9	236 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PCDH7	O60245	1069 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ANGPTL1	O95841	491 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	KCNJ2	P63252	427 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ECH1	Q13011	328 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	KLF10	Q13118	480 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	GRM2	Q14416	872 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MR1	Q95460	341 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	SNX27	Q96L92	541 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998		H3BSH0	61 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	LDB2	O43679	373 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MPZL2	O60487	215 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	TGFB1	P01137	390 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ESR1	P03372	595 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CHIA	Q9BZP6	476 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	FSCN2	O14926	492 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CCNE2	O96020	404 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	SRC	P12931	536 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CRHR1	P34998	444 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PER3-209	ENST00000614998	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33

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