RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 TYROBPO43914 113 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TBL1XO60907 577 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RASGRP1O95267 797 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SNAP29O95721 258 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT7P0C024 238 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 IFI44LQ53G44 452 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PPM1JQ5JR12 505 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RPTNQ6XPR3 784 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 IFNL1Q8IU54 200 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MALT1Q9UDY8 824 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 H3BMQ9 156 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PPM1BO75688 479 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 ARHGEF15O94989 841 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CCR10P46092 362 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 GALEQ14376 348 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CHSY3Q70JA7 882 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 BEND5Q7L4P6 421 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF614Q8N883 585 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR4L1Q8NH43 312 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR8K3Q8NH51 312 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 COG8Q96MW5 612 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MYOM1P52179 1685 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HMX3A6NHT5 357 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 PRH1P02810 166 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NDST2P52849 883 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ARSFP54793 590 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CNTN2Q02246 1040 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CTBP1Q13363 440 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ARSKQ6UWY0 536 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 DET1Q7L5Y6 550 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FAM35AQ86V20 835 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CKLFQ9UBR5 152 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FBXO10Q9UK96 956 aa6.75□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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CLCN3-211ENST00000613795 NR2F1P10589 423 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RHOQP17081 205 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HDCP19113 662 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 UQCRC1P31930 480 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FGL2Q14314 439 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MEP1AQ16819 746 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SPARTQ8N0X7 666 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 LGALS12Q96DT0 336 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FUZQ9BT04 418 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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