RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 AZIN2Q96A70 460 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF333Q96JL9 665 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PKMYT1Q99640 499 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MYOCQ99972 504 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MECRQ9BV79 373 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SIK2Q9H0K1 926 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TASP1Q9H6P5 420 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SYTL2Q9HCH5 934 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 OSER1Q9NX31 292 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IL37Q9NZH6 218 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PDP2Q9P2J9 529 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 EMCNQ9ULC0 261 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CDYLQ9Y232 598 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DOCK3Q8IZD9 2030 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM92AA1XBS5 289 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CDHR4A6H8M9 788 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 E9PAM4 449 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 H0YJX3 145 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 K7ESF4 209 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF195O14628 629 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HCRTO43612 131 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM24O75264 130 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PROP1O75360 226 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GLP2RO95838 553 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 AHSGP02765 367 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FGF1P05230 155 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ASGR1P07306 291 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DDCP20711 480 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IMPDH1P20839 514 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CD9P21926 228 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 YWHAQP27348 245 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NMBRP28336 390 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CD52P31358 61 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CPOXP36551 454 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACADVLP49748 655 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CSRP3P50461 194 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ATP4BP51164 291 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NAGLUP54802 743 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MTTPP55157 894 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ATP6V0D1P61421 351 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CRADDP78560 199 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP8P85298 464 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 BTKQ06187 659 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DSC1Q08554 894 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GRIK2Q13002 908 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB17Q13105 803 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPR17Q13304 367 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ART3Q13508 389 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TUBB3Q13509 450 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 BFSP2Q13515 415 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ITGA7Q13683 1181 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 LPIN1Q14693 890 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GRM3Q14832 879 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CCL14Q16627 93 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACCSLQ4AC99 568 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CST9Q5W186 159 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF280DQ6N043 979 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms