RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSRB2Q9Y3D2 182 aa32.1■■■□□ 2.73
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BTN3A1O00481 513 aa32.1■■■□□ 2.73
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf74A8MZ97 194 aa32.07■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POMT2Q9UKY4 750 aa32.07■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD17B3P37058 310 aa32.05■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP295Q9C0D2 2601 aa32.04■■■□□ 2.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT37O76014 449 aa32.04■■■□□ 2.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSRP3P50461 194 aa32.04■■■□□ 2.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DS3Q14952 304 aa32.04■■■□□ 2.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP2A13Q16696 494 aa32.04■■■□□ 2.72
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