RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MSL3P1	P0C860	447 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CYP2A7	P20853	494 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MGAT1	P26572	445 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	COL8A1	P27658	744 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	RORA	P35398	523 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TERF1	P54274	439 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	IL10RA	Q13651	578 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ZIC1	Q15915	447 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FHL5	Q5TD97	284 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	C4orf22	Q6V702	233 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	HOOK3	Q86VS8	718 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PRELID2	Q8N945	189 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	LRFN5	Q96NI6	719 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CARD6	Q9BX69	1037 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM60A	Q9NP50	221 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987		F8W8V4	182 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MAP3K7	O43318	606 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	HCRTR1	O43613	425 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GPC4	O75487	556 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	NPY2R	P49146	381 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PMS2	P54278	862 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ITGA1	P56199	1179 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	KLRB1	Q12918	225 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	UGT8	Q16880	541 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CES3	Q6UWW8	571 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SYVN1	Q86TM6	617 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	IL22	Q9GZX6	179 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SYBU	Q9NX95	663 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	BFAR	Q9NZS9	450 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MED13	Q9UHV7	2174 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987		A0A0J9YY10	115 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ISM1	B1AKI9	464 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987		E7EQ34	232 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF749	O43361	778 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	RFPL1	O75677	317 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJB5	O75953	348 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CAPN1	P07384	714 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CTSB	P07858	339 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TPSB2	P20231	275 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ARNT	P27540	789 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	AOAH	P28039	575 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PKLR	P30613	574 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GABRA4	P48169	554 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TTPA	P49638	278 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	VPS41	P49754	854 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MLLT10	P55197	1068 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TPSAB1	Q15661	275 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	CPZ	Q66K79	652 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	MFSD3	Q96ES6	412 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TCTN2	Q96GX1	697 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	P2RY12	Q9H244	342 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	TLK1	Q9UKI8	766 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987		H3BMH7	237 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	AP3B1	O00203	1094 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	VPS4B	O75351	444 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	APOA4	P06727	396 aa		15.21	■□□□□ 0.03
NUBP2-208	ENST00000565987	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		15.21	■□□□□ 0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms