RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR1I1O60431 355 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FOLR3P41439 243 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KYNUQ16719 465 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SYTL3Q4VX76 610 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DCAF10Q5QP82 559 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PEX26Q7Z412 305 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C5AR2Q9P296 337 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAP10Q9P2G4 905 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AMFRQ9UKV5 643 aa16.09■□□□□ 0.17
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A0U1RQJ8 604 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ISM1B1AKI9 464 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UMODP07911 640 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR56A5P0C7T3 313 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VRK3Q8IV63 474 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GALNT16Q8N428 558 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IP6K3Q96PC2 410 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MENTQ9BUN1 341 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CASS4Q9NQ75 786 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.08■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ICE1Q9Y2F5 2266 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PSMD3O43242 534 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FTCDO95954 541 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ITGAXP20702 1163 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAGP20916 626 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PKLRP30613 574 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCR7P32248 378 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRIA1P42261 906 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GCGRP47871 477 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF75DP51815 510 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDH17Q12864 832 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEMA3AQ14563 771 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MYBPC3Q14896 1274 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KIR2DS3Q14952 304 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF534Q76KX8 674 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LINC00523Q86TU6 105 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRR7Q8TB68 274 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HDAC10Q969S8 669 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF778Q96MU6 729 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLCL2Q9UPR0 1127 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A1L4Q6 167 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PEX12O00623 359 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RAB28P51157 221 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ACVR1Q04771 509 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRB7Q14451 532 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NR6A1Q15406 480 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KIAA1328Q86T90 577 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IQCKQ8N0W5 287 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INPP5DQ92835 1189 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PTERQ96BW5 349 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NDC1Q9BTX1 674 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.06■□□□□ 0.16
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms