RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 HOXC8P31273 242 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PTGER3P43115 390 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 GNPDA1P46926 289 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 DAPP51397 102 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 IFITM2Q01629 132 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 17.3
CS-202ENST00000542324 FBXO43Q4G163 708 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 OVOS1Q6IE37 1185 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CES5AQ6NT32 575 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NAT16Q8N8M0 369 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ITCHQ96J02 903 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 UROC1Q96N76 676 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TINF2Q9BSI4 451 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SIAEQ9HAT2 523 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 POLE4Q9NR33 117 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MIOSQ9NXC5 875 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 VNN3Q9NY84 501 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 VPS51Q9UID3 782 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 C17orf102A2RUQ5 167 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ARL5CA6NH57 179 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 AIREO43918 545 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MAN1A2O60476 641 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NIPSNAP2O75323 286 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MED26O95402 600 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 DLGAP3O95886 979 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SEMG1P04279 462 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 S100A5P33763 92 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 KRT20P35900 424 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CTSKP43235 329 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NEK2P51955 445 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ELP6Q0PNE2 266 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 STEAP3Q658P3 488 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 FBXL22Q6P050 247 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 LRRTM3Q86VH5 581 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NETO1Q8TDF5 533 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CDK15Q96Q40 435 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 OR52E6Q96RD3 313 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CEP44Q9C0F1 390 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 NEK6Q9HC98 313 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 FBXO10Q9UK96 956 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MKLN1Q9UL63 735 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 DHRS7Q9Y394 339 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 E5RI56 91 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TBX1O43435 398 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 APOA1P02647 267 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PRSS56P0CW18 603 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PRPS2P11908 318 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 FSHRP23945 695 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 TRPC1P48995 793 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 PGFP49763 221 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 SLC13A2Q13183 592 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 DGCR6Q14129 220 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 GRB14Q14449 540 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 CARD16Q5EG05 197 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-202ENST00000542324 COLEC12Q5KU26 742 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.5 ms