RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 UQCRBP14927 111 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 GGT5P36269 586 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 IL23RQ5VWK5 629 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM154Q6P9G4 183 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 LILRA2Q8N149 483 aa19.77■□□□□ 0.76
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PACSIN3-211ENST00000539589 ASB11Q8WXH4 323 aa19.77■□□□□ 0.76
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PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC8Q9BY41 377 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC32A1Q9H598 525 aa19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC730098B7Z3J9 87 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 ELP6Q0PNE2 266 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 DYRK4Q9NR20 520 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 CMTM6Q9NX76 183 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 RNF11Q9Y3C5 154 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 FTH1P02794 183 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 Q7L0L9 218 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 EFHD1Q9BUP0 239 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC29A3Q9BZD2 475 aa19.76■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 FADS3Q9Y5Q0 445 aa19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 QSOX1O00391 747 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
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PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2A7P20853 494 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 MED21Q13503 144 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 CST6Q15828 149 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 TIGD2Q4W5G0 525 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 PAGE3Q5JUK9 113 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK10Q6ZWH5 1172 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 NRSN1Q8IZ57 195 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2T34Q8NGX1 318 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2T3Q8NH03 318 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 ELMO1Q92556 727 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 AP2M1Q96CW1 435 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 A6NHS1 94 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 GFYI3L273 518 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 MANBAO00462 879 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 NPC1O15118 1278 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 SGTAO43765 313 aa19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3-211ENST00000539589 SOD1P00441 154 aa19.75■□□□□ 0.75
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