RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, human

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBASH3B-208	ENST00000533451	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	GPR21	Q99679	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ESYT3	A0FGR9	886 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TUBB4A	P04350	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PVR	P15151	417 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	UGT2B7	P16662	529 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	SAT1	P21673	171 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CD82	P27701	267 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TLE3	Q04726	772 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CLN3	Q13286	438 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	GPR19	Q15760	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	STK17B	O94768	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	SPTB	P11277	2137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MCM3	P25205	808 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PKLR	P30613	574 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CCNF	P41002	786 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAB28	P51157	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	UCN	P55089	124 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CAV1	Q03135	178 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ACY1	Q03154	408 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MGAT5	Q09328	741 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBASH3B-208	ENST00000533451	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms