RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	S1PR4	O95977	384 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT-ND3	P03897	115 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOA4	P06727	396 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN1	P07384	714 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCN2	P20062	427 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FMO4	P31512	558 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLE2	P56282	527 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEPRO	Q6NW34	567 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREG2	Q8IUH2	290 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRFN5	Q96NI6	719 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CATSPER2	Q96P56	530 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF12	Q99081	682 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A3	Q99726	388 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCSK5	Q92824	1860 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0J9YY10	115 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014		B8ZZF3	427 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C21orf140	B9A014	251 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREG1	O75629	220 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	BDKRB1	P46663	353 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB28	P51157	221 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf46	Q6P387	395 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM136A	Q96C01	138 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PANX3	Q96QZ0	392 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RELN	P78509	3460 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED13	Q9UHV7	2174 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEB16	A2A368	324 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEN1	O00255	615 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASGRF2	O14827	1237 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TP73	O15350	636 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KATNA1	O75449	491 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	BANF1	O75531	89 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP1	O94782	785 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MATN4	O95460	622 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RECK	O95980	971 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESR1	P03372	595 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD9	P21926	228 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCGR	P47871	477 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLCN7	P51798	805 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFKB2	Q00653	900 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MC1R	Q01726	317 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFATC3	Q12968	1075 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNAB2	Q13303	367 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTBP1	Q13363	440 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL10RA	Q13651	578 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTK6	Q13882	451 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERV3-1	Q14264	604 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR2DS3	Q14952	304 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMED2	Q15363	201 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.25	□□□□□ -0.45

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