RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 TECRLQ5HYJ1 363 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SULT1C3Q6IMI6 304 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 OR52E1Q8NGJ3 308 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 OR10G6Q8NH81 332 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PATE1Q8WXA2 126 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC22A18Q96BI1 424 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 FBXL8Q96CD0 374 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 GPR78Q96P69 363 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa17.07■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.326e-7■■■□□ 18.4
CTDSP1-215ENST00000498160 DUX1O43812 170 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SH3BP5O60239 455 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SASH3O75995 380 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ZWINTO95229 277 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SYF2O95926 243 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ERGP11308 486 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 BDKRB1P46663 353 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PGGT1BP53609 377 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ASPHQ12797 758 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PRKAA1Q13131 559 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 GPR18Q14330 331 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 NAA25Q14CX7 972 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TGFBIQ15582 683 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CYP2A13Q16696 494 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 GLRX5Q86SX6 157 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PIP4P1Q86T03 277 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 OOSP2Q86WS3 158 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PDPRQ8NCN5 879 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 OR2L8Q8NGY9 312 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PTERQ96BW5 349 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ATOH8Q96SQ7 321 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 EGFL8Q99944 293 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PCBD2Q9H0N5 130 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SRMSQ9H3Y6 488 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 KCNK4Q9NYG8 393 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CD274Q9NZQ7 290 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 XPR1Q9UBH6 696 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 BTBD3Q9Y2F9 522 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 RNF215Q9Y6U7 377 aa17.06■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PPM1DO15297 605 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CBFA2T3O75081 653 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SUPT3HO75486 399 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PKLRP30613 574 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 GLRBP48167 497 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PRKG2Q13237 762 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PHKG1Q16816 387 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ARMC6Q6NXE6 501 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SMPDL3AQ92484 453 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 RAB33BQ9H082 229 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CAAP1Q9H8G2 361 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PLLPQ9Y342 182 aa17.05■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC30A4O14863 429 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TYROBPO43914 113 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 GDF9O60383 454 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 UBXN7O94888 489 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 AMD1P17707 334 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PNLIPRP1P54315 467 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 NFKB2Q00653 900 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 E2F1Q01094 437 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SQSTM1Q13501 440 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 KIR2DS3Q14952 304 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 OR4D1Q15615 310 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CARFQ8N187 725 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 IFI44Q8TCB0 444 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 DLG3Q92796 817 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 PKP4Q99569 1192 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM216Q9P0N5 145 aa17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1-215ENST00000498160 U3KQA8 63 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms