RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 UGT2B7P16662 529 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SOX11P35716 441 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PMP22Q01453 160 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 UBXN1Q04323 297 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 GBE1Q04446 702 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CACNG1Q06432 222 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 LTBQ06643 244 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB17Q13105 803 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MYBPHQ13203 477 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DPYSL3Q14195 570 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 GRM7Q14831 915 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PCOLCEQ15113 449 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PDK2Q15119 407 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CDSNQ15517 529 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CEBPEQ15744 281 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC14A2Q15849 920 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 BCL7AQ4VC05 210 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 DAAM2Q86T65 1068 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PHC3Q8NDX5 983 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ZNF398Q8TD17 642 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 NINJ1Q92982 152 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 MIEF2Q96C03 454 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 C8orf44Q96CB5 159 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CEP41Q9BYV8 373 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 RNF32Q9H0A6 362 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CUTCQ9NTM9 273 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 EURLQ9NYK6 297 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 C3orf18Q9UK00 162 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 PPT2Q9UMR5 302 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.9□□□□□ -1.46
CBX1-205ENST00000495350 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 OR5H15A6NDH6 313 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LGALS16A8MUM7 142 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 E9PLN8 166 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MYO1FO00160 1098 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RASGRF2O14827 1237 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SERPINA7P05543 415 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GABRA4P48169 554 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CD151P48509 253 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PRLHRP49683 370 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 KLC1Q07866 573 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RPA4Q13156 261 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PDK1Q15118 436 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZIC1Q15915 447 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZNF766Q5HY98 468 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TCTE1Q5JU00 501 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 COX15Q7KZN9 410 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NDUFAF7Q7L592 441 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BIVMQ86UB2 503 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GHDCQ8N2G8 530 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CNTD1Q8N815 330 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NIPA2Q8N8Q9 360 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.89□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms