RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ERVK-10P10266 1014 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PKLRP30613 574 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ELK3P41970 407 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RAB28P51157 221 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TUBB4BP68371 445 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 C2orf54Q08AI8 447 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CUL1Q13616 776 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TUBB2AQ13885 445 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GRB7Q14451 532 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MORF4L2Q15014 288 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SPESP1Q6UW49 350 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PCSK4Q6UW60 755 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KCNMB4Q86W47 210 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CARFQ8N187 725 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZBTB2Q8N680 514 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CFAP36Q96G28 342 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SNF8Q96H20 258 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR2A14Q96R47 310 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SLC30A3Q99726 388 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MENTQ9BUN1 341 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 IL17BQ9UHF5 180 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 METRNQ9UJH8 293 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 BTRCQ9Y297 605 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MED16Q9Y2X0 877 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SNX24Q9Y343 169 aa7.26□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PCM1Q15154 2024 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 NKX2-8O15522 239 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RAD51CO43502 376 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 HCRTR1O43613 425 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KDM1AO60341 852 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SCRG1O75711 98 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 C1orf105O95561 183 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PRB1P04280 392 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RPN2P04844 631 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CD9P21926 228 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 F8A1P23610 371 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 STAT5AP42229 794 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CLCN7P51798 805 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 RHDQ02161 417 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ABHD18Q0P651 414 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 MAP7Q14244 749 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 GBX1Q14549 363 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZIC1Q15915 447 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 HIF1AQ16665 826 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KYNUQ16719 465 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TTC23LQ6PF05 361 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 PDIK1LQ8N165 341 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ESX1Q8N693 406 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 OR1L3Q8NH93 324 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CALML6Q8TD86 181 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 TTC9Q92623 222 aa7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PATJ-211ENST00000493967 CERS2Q96G23 380 aa7.25□□□□□ -1.25
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