RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC58Q96CX6 371 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM74Q96NL1 305 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RDH12Q96NR8 316 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TASP1Q9H6P5 420 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.76□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0J9YYE9 177 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTLL8A6PVC2 850 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCKDKO14874 412 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HPGDSO60760 199 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GCP02774 474 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTAFRP25105 342 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMA2P25787 234 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRDX5P30044 214 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIE1P35590 1138 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPAN7P41732 249 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MVKQ03426 396 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAM15Q13444 863 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRAPQ13588 217 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 QPRTQ15274 297 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR33Q49SQ1 333 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAXO2Q658L1 398 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM270Q6UE05 265 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GANCQ8TET4 914 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBE2FQ969M7 185 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 AP2M1Q96CW1 435 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RTP4Q96DX8 246 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OMDQ99983 421 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPZ2Q9P299 210 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARID2Q68CP9 1835 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFCAB7A8K855 629 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYL12BO14950 172 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SGCEO43556 437 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSF3P09919 207 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYL12AP19105 171 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSTR2P30874 369 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADRA1BP35368 520 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2orf80Q0P641 193 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAX1Q8IWV1 398 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGAP2Q99490 1192 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBBP8Q99708 897 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NHSQ6T4R5 1651 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRAPQ86VF7 1730 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PPL8 197 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TARM1B6A8C7 271 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD9O00144 591 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF10BO14763 440 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGLEC5O15389 551 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC16A6O15403 523 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHMP2AO43633 222 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP4B1P13584 511 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGAT1P26572 445 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU3F4P49335 361 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB13P51153 203 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4D2P58180 307 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCN1BQ07699 218 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MADCAM1Q13477 382 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL18R1Q13478 541 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NKG7Q16617 165 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB6CQ53S08 254 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 AHSA2Q719I0 299 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.75□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MICALL2Q8IY33 904 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms