RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PRV1 198 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PGRMC2O15173 223 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SYNGR3O43761 229 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KINO60870 393 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TOMM70O94826 608 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LIPFP07098 398 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PDGFRAP16234 1089 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DGKAP23743 735 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PSMC4P43686 418 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NT5C2P49902 561 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF75DP51815 510 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF132P52740 706 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ARF5P84085 180 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TEFQ10587 303 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TUBB2AQ13885 445 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPATA20Q8TB22 786 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ATL1Q8WXF7 558 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NXNL1Q96CM4 212 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF558Q96NG5 402 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TMEM237Q96Q45 408 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 EGFL8Q99944 293 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ABHD6Q9BV23 337 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DPP3Q9NY33 737 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TRIM17Q9Y577 477 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SYCE3A1L190 88 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLCO2B1O94956 709 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HMOX1P09601 288 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 OR2T7P0C7T2 308 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DANCRP0C864 163 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ITGB6P18564 788 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PCGF2P35227 344 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZNF273Q14593 569 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 GRTP1Q5TC63 336 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 FAM198BQ6UWH4 519 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 POC1AQ8NBT0 407 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLAMF9Q96A28 289 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ERO1AQ96HE7 468 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V0BQ99437 205 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TSPY26PQ9H489 355 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GUV1 79 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 NDC80O14777 642 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 IKBKBO14920 756 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 TXNL1O43396 289 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 SEC22BO75396 215 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-204ENST00000489160 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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