RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NAT14Q8WUY8 206 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SCYL1Q96KG9 808 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CCDC138Q96M89 665 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 C12orf66Q96MD2 445 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 UCK1Q9HA47 277 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ASF1AQ9Y294 204 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MAST4O15021 2626 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TMEM120BA0PK00 339 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TARM1B6A8C7 271 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 YY2O15391 372 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 BIRC5O15392 142 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ZW10O43264 779 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SNX2O60749 519 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PROCP04070 461 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ANXA5P08758 320 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NR1D1P20393 614 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RPIAP49247 311 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NFKB2Q00653 900 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TGFBIQ15582 683 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RPE65Q16518 533 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SBSNQ6UWP8 590 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NAPRTQ6XQN6 538 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SFRP1Q8N474 314 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MDM1Q8TC05 714 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MAPK15Q8TD08 544 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SAP25Q8TEE9 199 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ALG9Q9H6U8 611 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 LRP4O75096 1905 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MYO1CO00159 1063 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CDC7O00311 574 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 STX16O14662 325 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 FFAR2O15552 330 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 KLK8O60259 260 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SPAG7O75391 227 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 VIPP01282 170 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 MYL2P10916 166 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CPA3P15088 417 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CCND1P24385 295 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ETV4P43268 484 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 FASLGP48023 281 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 C1orf61Q13536 156 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CLCA4Q14CN2 919 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SHBQ15464 509 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A45Q8N413 288 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 PDPRQ8NCN5 879 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 GPR156Q8NFN8 814 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 OR4C6Q8NH72 309 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-211ENST00000488243 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms