RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CLPTM1	O96005	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	VIP	P01282	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGAX	P20702	1163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBA4A	P68366	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NUS1	Q96E22	293 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RHOV	Q96L33	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MIPEP	Q99797	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		A8MX80	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ASNA1	O43681	348 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GDF9	O60383	454 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AK1	P00568	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ANXA8	P13928	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGAL	P20701	1170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65	3e-7	■■■■■ 27.1
KRIT1-222	ENST00000486261	ABCD3	P28288	659 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CD40LG	P29965	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NFATC4	Q14934	902 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	EMC1	Q8N766	993 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TCHH	Q07283	1943 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CHUK	O15111	745 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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