RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 FDCSPQ8NFU4 85 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 SEC14L1Q92503 715 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 LRFN5Q96NI6 719 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 NUDT9Q9BW91 350 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 MFRPQ9BY79 579 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 NLNQ9BYT8 704 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 FANCEQ9HB96 536 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 MLXIPLQ9NP71 852 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 V9GYY5 206 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 H7C0S8 307 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 MATN2O00339 956 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 TMEM63AO94886 807 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 GAS8O95995 478 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 IFNB1P01574 187 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 KRT14P02533 472 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 RAB40ALP0C0E4 278 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 RHOXF2BP0C7M4 288 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 UGT2B7P16662 529 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 STIP1P31948 543 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 RPL22P35268 128 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 CD151P48509 253 aa12.21□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 ATP1A4Q13733 1029 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PTK6Q13882 451 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 C1orf189Q5VU69 101 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 UNC5AQ6ZN44 842 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.21□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 CPT1CQ8TCG5 803 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 STYXQ8WUJ0 223 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.21□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 MVB12BQ9H7P6 319 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PRAME-212ENST00000485532 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
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PRAME-212ENST00000485532 E7EQ34 232 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 H3BMH7 237 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MASP2O00187 686 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OR1I1O60431 355 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM4O75871 244 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MSL3P1P0C860 447 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CBSLP0DN79 551 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 GP1BBP13224 206 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ACADLP28330 430 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FOXN2P32314 431 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CBSP35520 551 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 RPA4Q13156 261 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 NCF4Q15080 339 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R7Q15435 360 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SPESP1Q6UW49 350 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CCDC89Q8N998 374 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 Q8NA96 180 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 OR52K1Q8NGK4 314 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ELMO1Q92556 727 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 C19orf43Q9BQ61 176 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 VPS37BQ9H9H4 285 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 CIDEBQ9UHD4 219 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SERTAD3Q9UJW9 196 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ASF1AQ9Y294 204 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 ICE1Q9Y2F5 2266 aa12.2□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 MROH6A6NGR9 719 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 VPS4BO75351 444 aa12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PRAME-212ENST00000485532 AP2A1O95782 977 aa12.19□□□□□ -0.46
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