RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 SPARCL1Q14515 664 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 COX20Q5RI15 118 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SPESP1Q6UW49 350 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 GPR135Q8IZ08 494 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 NXPE1Q8N323 547 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 GRHL3Q8TE85 626 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IP6K3Q96PC2 410 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 HGH1Q9BTY7 390 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CREBBPQ92793 2442 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ITPR2Q14571 2701 aa8.13□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SERTM1A2A2V5 107 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL33A6NCF5 533 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 C5orf60A6NFR6 353 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SOCS6O14544 535 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL18O94889 574 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MBD3O95983 291 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ALPPP05187 535 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PYGMP11217 842 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ALAS2P22557 587 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ITGA3P26006 1051 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ACADLP28330 430 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 Q0VFX4 171 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 TFDP2Q14188 446 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 BRD3Q15059 726 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SARM1Q6SZW1 724 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SNX20Q7Z614 316 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SLC34A3Q8N130 599 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AMER2Q8N7J2 671 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 FAR1Q8WVX9 515 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 P3H4Q92791 437 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 COPS8Q99627 209 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ALG6Q9Y672 507 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.12□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP9Q99996 3911 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 H7C0C1 242 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AGPSO00116 658 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 AKR1B10O60218 316 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 IGHEP01854 428 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 RALBP11234 206 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 TPH1P17752 444 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 PSMB4P28070 264 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MC4RP32245 332 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 SLC1A1P43005 524 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5OP48047 213 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 MARCKSL1P49006 195 aa8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CTPS1-208ENST00000479480 GEMP55040 296 aa8.11□□□□□ -1.11
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