RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SERHLQ9NQF3 203 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KCTD3Q9Y597 815 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OOEPA6NGQ2 149 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CTDSP2O14595 271 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 INSIG1O15503 277 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PDE9AO76083 593 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MPOP05164 745 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 EPHX1P07099 455 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KRT15P19012 456 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TNFRSF1AP19438 455 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MYF6P23409 242 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 POU1F1P28069 291 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ICAM3P32942 547 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CDK7P50613 346 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 REEP5Q00765 189 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FGL2Q14314 439 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 INPP5AQ14642 412 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PDK2Q15119 407 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SYT16Q17RD7 645 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 EPC2Q52LR7 807 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM177Q53S58 311 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FUT10Q6P4F1 479 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HAUS6Q7Z4H7 955 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CCNYQ8ND76 341 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CD101Q93033 1021 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PERPQ96FX8 193 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DGAT2Q96PD7 388 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FIZ1Q96SL8 496 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 FOLH1BQ9HBA9 442 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF98A6NK75 572 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ITGB1BP1O14713 200 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HBP1O60381 514 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GPR32O75388 356 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KRT75O95678 551 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SNAP29O95721 258 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MBD3O95983 291 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MBP02144 154 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 APOC1P02654 83 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 KITP10721 976 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CBR1P16152 277 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP2R1AP30153 589 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 HOXC9P31274 260 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CHRNA4P43681 627 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 BCAP31P51572 246 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 MAP2K6P52564 334 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC16A1P53985 500 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ST8SIA6P61647 398 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GHRHRQ02643 423 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 GRIN1Q05586 938 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SPOCK1Q08629 439 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 CYTH1Q15438 398 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 ETFDHQ16134 617 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 STX1AQ16623 288 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC36A3Q495N2 470 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX44Q53QW1 395 aa5.95□□□□□ -1.46
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