RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1-203ENST00000463369 XPR1Q9UBH6 696 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
SHQ1-203ENST00000463369 H0Y626 953 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 H0YC42 278 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 EREGO14944 169 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GRAP2O75791 330 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MFN2O95140 757 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ALPLP05186 524 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 M6PRP20645 277 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SAT1P21673 171 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SLC6A2P23975 617 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PSMB4P28070 264 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TIE1P35590 1138 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 C21orf58P58505 322 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 VBP1P61758 197 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 INCA1Q0VD86 236 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ACAP2Q15057 778 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MEP1AQ16819 746 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 AGAP6Q5VW22 663 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 STRADAQ7RTN6 431 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC103Q8IW40 242 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FAR1Q8WVX9 515 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DIO2Q92813 273 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 AGAP4Q96P64 663 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GPR78Q96P69 363 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 OMDQ99983 421 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CHID1Q9BWS9 393 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MAGEH1Q9H213 219 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 NTN4Q9HB63 628 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IL37Q9NZH6 218 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 M0QYV0 167 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FXYD1O00168 92 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CDK2AP1O14519 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TBX1O43435 398 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 CILPO75339 1184 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SOAT2O75908 522 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 B3GAT3O94766 335 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 NDST3O95803 873 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IMPDH1P20839 514 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IL12AP29459 219 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RAP1GAPP47736 663 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PGGT1BP53609 377 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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SHQ1-203ENST00000463369 ACOX1Q15067 660 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 DPYSL2Q16555 572 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 KCNMB4Q86W47 210 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 NATD1Q8N6N6 113 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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SHQ1-203ENST00000463369 HERVK_113Q902F9 699 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LRRC58Q96CX6 371 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 YIPF6Q96EC8 236 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 SENP8Q96LD8 212 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LGMNQ99538 433 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LGR4Q9BXB1 951 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 ACOT9Q9Y305 439 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-203ENST00000463369 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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