RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 ZG16O60844 167 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MARCKSL1P49006 195 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 RPA4Q13156 261 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 RBBP7Q16576 425 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KCNMB4Q86W47 210 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 AGAP4Q96P64 663 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OR2A14Q96R47 310 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CHP1Q99653 195 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 F8P00451 2351 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GX78 115 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KCNN4O15554 427 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CBFA2T2O43439 604 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KDM1AO60341 852 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 29.4
DDX39B-211ENST00000449757 APOC2P02655 101 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 EDN3P14138 238 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PRF1P14222 555 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ADRA1AP35348 466 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TAZQ16635 292 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 DBN1Q16643 649 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GPR33Q49SQ1 333 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 POLG2Q9UHN1 485 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 POLQO75417 2590 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 AGAP14A8MT82 685 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 H3BMH7 237 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MFAP3LO75121 409 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 AP2A2O94973 939 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FTH1P02794 183 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GSTM1P09488 218 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MAGP20916 626 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MMP11P24347 488 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GABRA4P48169 554 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 GSTM4Q03013 218 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 CACNG1Q06432 222 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 POU6F1Q14863 301 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 RANBP10Q6VN20 620 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 BBS12Q6ZW61 710 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 ACTL9Q8TC94 416 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 COG1Q8WTW3 980 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FAR1Q8WVX9 515 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 FKBP10Q96AY3 582 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-211ENST00000449757 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms