RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ELP6Q0PNE2 266 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CDH17Q12864 832 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DUPD1Q68J44 220 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DAW1Q8N136 415 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF276Q8N554 614 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TLE6Q9H808 572 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CENPPQ6IPU0 288 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LINGO2Q7L985 606 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.49□□□□□ -1.53
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