RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IDNKQ5T6J7 187 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PAQR7Q86WK9 346 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ING5Q8WYH8 240 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HERVK_113Q902F9 699 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMEM68Q96MH6 324 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NUDT15Q9NV35 164 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PPLO60437 1756 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 YDJCA8MPS7 323 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS3O15072 1205 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EPHX1P07099 455 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 AHCYP23526 432 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CXCR1P25024 350 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 XKP51811 444 aa6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 MC1RQ01726 317 aa6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 TAF10Q12962 218 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CHIT1Q13231 466 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NAT16Q8N8M0 369 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C12orf29Q8N999 325 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DGAT2Q96PD7 388 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LRRC3Q9BY71 257 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DIP2BQ9P265 1576 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ASTN1O14525 1302 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HYKKA2RU49 373 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GJB6O95452 261 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C8BP07358 591 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 COL6A1P12109 1028 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HSPB3Q12988 150 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CEP97Q8IW35 865 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HAPLN3Q96S86 360 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GPR21Q99679 349 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQY0 241 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARL5CA6NH57 179 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CLDN5O00501 218 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CXCR6O00574 342 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IRAK2O43187 625 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PDYNP01213 254 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAB21L1Q13394 359 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TIGD6Q17RP2 521 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LIN52Q52LA3 116 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.56□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 CHST9Q7L1S5 443 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NXPE1Q8N323 547 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SPERTQ8NA61 448 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GPR151Q8TDV0 419 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 BORCS8Q96FH0 119 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.56□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PQH9 124 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF878C9JN71 531 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC7A4O43246 635 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PRKD3O94806 890 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MPSTP25325 297 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HSPA7P48741 367 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CDH12P55289 794 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 VGLL4Q14135 290 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TRAM1Q15629 374 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.55□□□□□ -1.36
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