RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CD63P08962 238 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 AMPD1P23109 780 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN7P35236 360 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ARSEP51690 589 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ACY1Q03154 408 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MPP2Q14168 576 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PELI3Q8N2H9 469 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GDAP1Q8TB36 358 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KRT35Q92764 455 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LRFN5Q96NI6 719 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PDE7BQ9NP56 450 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CHKBQ9Y259 395 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LAMA5O15230 3695 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 UBXN7O94888 489 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CBX6O95503 412 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 VIPP01282 170 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 JCHAINP01591 159 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 POLD2P49005 469 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 EMP3P54852 163 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CTAG1AP78358 180 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PDE1BQ01064 536 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DR1Q01658 176 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TOMM20Q15388 145 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 UGT8Q16880 541 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SYVN1Q86TM6 617 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BBOF1Q8ND07 529 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ALG3Q92685 438 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 INPP5DQ92835 1189 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 IP6K3Q96PC2 410 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MIPEPQ99797 713 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PADI1Q9ULC6 663 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM120BA0PK00 339 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf81A6NN90 581 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MATN2O00339 956 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 IDSP22304 550 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SERPINB3P29508 390 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HALP42357 657 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CAPZBP47756 277 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NEK2P51955 445 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ITKQ08881 620 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 AP1B1Q10567 949 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GTF2H3Q13889 308 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TFDP2Q14188 446 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RASA2Q15283 850 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DENND2CQ68D51 928 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DOK6Q6PKX4 331 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KCTD6Q8NC69 237 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HACD3Q9P035 362 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NKX2-8O15522 239 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MTSS1O43312 755 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CREG1O75629 220 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms