RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 ICKQ9UPZ9 632 aa7.6□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ARL5AQ9Y689 179 aa7.6□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.6□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 A0A0J9YY10 115 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 C2orf81A6NN90 581 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CFAP99D6REC4 459 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 JRKO75564 520 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC175P0C221 793 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TPBGLP0DKB5 382 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ACADLP28330 430 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ADRA1AP35348 466 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CDKN2BP42772 138 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TDGF1P3P51864 188 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CDC16Q13042 620 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 MFAP5Q13361 173 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 INAQ16352 499 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 NKG7Q16617 165 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 GPR33Q49SQ1 333 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 PID1Q7Z2X4 250 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 SNX20Q7Z614 316 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 FJX1Q86VR8 437 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF567Q8N184 647 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 BCORP1Q8N888 145 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TC2NQ8N9U0 490 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 IPMKQ8NFU5 416 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 DLG3Q92796 817 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 SPSB2Q99619 263 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 COPS8Q99627 209 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 NDC1Q9BTX1 674 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 XKR8Q9H6D3 395 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 OLAHQ9NV23 265 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.59□□□□□ -1.19
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1B0GX78 115 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC78A2IDD5 438 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 MFAP3LO75121 409 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 KLHL18O94889 574 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 AGTP01019 485 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM253P0C7T8 217 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 SHMT2P34897 504 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ARSFP54793 590 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 Q0VFX4 171 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 PRKG2Q13237 762 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TFDP2Q14188 446 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 MESDQ14696 234 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 SLC9A5Q14940 896 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 KIR2DS3Q14952 304 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TCEAL1Q15170 157 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 SLC18A3Q16572 532 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 MTFR2Q6P444 385 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 COX15Q7KZN9 410 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TRIM73Q86UV7 250 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 HOOK3Q86VS8 718 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 RFX6Q8HWS3 928 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00578-201ENST00000439009 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms