RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BBS9Q3SYG4 887 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKS6Q68DC2 871 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNMB4Q86W47 210 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT222Q8N1A0 295 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 D2HGDHQ8N465 521 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB2Q8N680 514 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INPP5DQ92835 1189 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAP3K3Q99759 626 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB17Q9H0T7 212 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRORYQ9H606 182 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDE7BQ9NP56 450 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POMT2Q9UKY4 750 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTRCQ9Y297 605 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX24Q9Y343 169 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.89□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FRYQ5TBA9 3013 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIPSLA2A3N6 862 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSAPA4D1B5 854 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ESPNB1AK53 854 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTN3A3O00478 584 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTN3A1O00481 513 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TP73O15350 636 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD51CO43502 376 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT37O76014 449 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MATN4O95460 622 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MT-ND3P03897 115 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDH3P22223 829 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD17B2P37059 387 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELK3P41970 407 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC1A2P43004 574 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEPHS1P49903 392 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXM1Q08050 763 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VAC14Q08AM6 782 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABHD18Q0P651 414 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIR2DS3Q14952 304 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MANEAQ5SRI9 462 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STEAP4Q687X5 459 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DUPD1Q68J44 220 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYS1Q717R9 158 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VRK3Q8IV63 474 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ESX1Q8N693 406 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NKD1Q969G9 470 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CERS2Q96G23 380 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR6C1Q96RD1 312 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HGH1Q9BTY7 390 aa7.88□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms